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對(duì)生長(zhǎng)發(fā)育和環(huán)境適應(yīng)性至關(guān)重要的調(diào)控基因在進(jìn)化過(guò)程中具有高度保守性。挖掘關(guān)鍵保守基因的方法之一是跨物種比較基因組學(xué)分析，該方法減少了物種異質(zhì)性的影響，并能揭示特定生物過(guò)程中的進(jìn)化保守機(jī)制。然而，當(dāng)前跨物種數(shù)據(jù)挖掘分析平臺(tái)尚不完善，限制了海量多組學(xué)數(shù)據(jù)的應(yīng)用和關(guān)鍵基因挖掘。

該數(shù)據(jù)庫(kù)以模式物種擬南芥同源基因?yàn)槊浇?，將不同園藝作物轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀組學(xué)等數(shù)據(jù)進(jìn)行比較，通過(guò)交互式分析可快速挖掘到關(guān)鍵功能基因。除了跨物種分析（Cross-species analysis），該數(shù)據(jù)庫(kù)還提供了基因表達(dá)分析（Gene expression）、物種內(nèi)比較分析（In-species analysis）、表觀調(diào)控分析（Epigenetic regulation）、基因共表達(dá)分析（Gene Co-expression）、GO/KEGG分析、進(jìn)化分析（phylogenetic analysis）等功能模塊，以及BLAST、同源基因查詢和基因序列獲取等實(shí)用工具。

迄今，該數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋了40個(gè)物種的參考基因組，包含近1.3萬(wàn)份高通量組學(xué)數(shù)據(jù)。論文以挖掘調(diào)控園藝作物采后儲(chǔ)藏保鮮的關(guān)鍵基因、鑒定菊花EIN3新功能等示例，展示了該數(shù)據(jù)庫(kù)應(yīng)用的便利性和有效性。

程華博士和張華博士為該論文共同第一作者，王利凱教授為論文通訊作者。陳發(fā)棣教授、陳素梅教授和蔣甲福教授，以及在讀研究生宋憬等參與了該工作。該研究獲國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目資助。