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Nat. Chem.:前奧地利擊劍手Andrea Rentmeister教授mRNA5'端化學(xué)修飾

來源:化學(xué)加網(wǎng)原創(chuàng)      2022-07-12
導(dǎo)讀:近日,德國明斯特大學(xué)Andrea Rentmeister教授在Nature Chemistry上發(fā)表了題為“Photocaged 5′ cap analogues for optical control of mRNA translation in cells”的研究文章(DOI: 10.1038/s41557-022-00972-7),研究了光籠5'帽類似物用于光控mRNA翻譯。這個光籠基團為光可切割基團(FlashCaps),其可與真核翻譯起始因子eIF4E結(jié)合,從而抵抗脫帽酶切割。當(dāng)采用激光進行輻照,則可恢復(fù)其高效翻譯。同時,F(xiàn)lashCaps克服了照射后mRNA中剩余序列結(jié)構(gòu)變化問題。

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圖1. 光籠5'帽類似物用于光控mRNA翻譯示意圖(圖片來源:Nat. Chem.

研究背景

信使RNA(簡稱mRNA)是一種參與蛋白質(zhì)合成的單鏈RNA。mRNA的作用是將蛋白質(zhì)信息從細(xì)胞核中的DNA傳送到細(xì)胞質(zhì),隨后讀取mRNA序列并將每個三堿基密碼子翻譯成其相應(yīng)的氨基酸。真核生物mRNA具有特定的 5'帽結(jié)構(gòu),其通過5'-5'三磷酸橋?qū)7-甲基化鳥苷連接到第一個轉(zhuǎn)錄核苷酸。5'帽結(jié)構(gòu)在翻譯起始中起關(guān)鍵作用,主要歸因于 N7 甲基化鳥苷對于翻譯起始因子eIF4E的特定識別。同時5'帽對于許多mRNA質(zhì)控起關(guān)鍵作用,并保護真核mRNA免受外切酶降解。mRNA周轉(zhuǎn)和體內(nèi)平衡需要專用的去蓋酶(Dcp1-2、DcpS)。5'帽與3'末端的poly(A)尾一起形成mRNA“閉環(huán)”,從而促進eIF4E和poly(A)結(jié)合蛋白之間的相互作用。沒有5'帽的RNA幾乎不翻譯,并且具有高度免疫原性。因此,用于生物學(xué)研究和治療應(yīng)用的mRNA的生產(chǎn)通常涉及5'-加帽。

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圖2. 真核生物mRNA翻譯啟動過程以及化學(xué)修飾的位點(圖片來源:Nat. Chem.

關(guān)鍵合成步驟

作者通過在5'端鳥苷N2引入光裂解基團,其中氨基甲酸甲酯作為橋連物可在光作用下有效裂解。以鳥苷為起始反應(yīng)物,首先使用三甲基甲硅烷基氯化物(Me3SiCl)保護羥基。然后在一鍋反應(yīng)中,將鳥苷的游離氨基轉(zhuǎn)化為異氰酸酯,通過與鄰硝基芐基 (ONB) 醇、3,4-二甲氧基- 2-硝基芐基(DMNB)醇、6-硝基胡椒基(NP)醇、6-硝基胡椒基-甲基(NPM)醇反應(yīng),形成光可裂解基團或紅移衍生物。之后用氨水(THF溶液)去除TMS基團以獲得光籠鳥苷。然后將光籠鳥苷在5'-OH處單磷酸化以產(chǎn)生圖二中6a,b化合物,甲基化后形成化合物7a,b,并與鳥苷-5'-二磷酸咪唑啉偶聯(lián)從而得到最終產(chǎn)物。

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圖3. 具有光可裂解基團(FlashCaps)的帽類似物以及光觸發(fā)翻譯的整體合成思路(圖片來源:Nat. Chem.

結(jié)構(gòu)及性能分析

作者進一步分析了N2位置具有光可裂解基團鳥苷的吸收光譜。ONB鳥苷僅在300?nm以上顯示低吸光度,DMNB鳥苷在350?nm處顯示最大吸收,NP和NPM鳥苷略微紅移,在360?nm處達(dá)到最大值。為了選擇最適合生物應(yīng)用的光可裂解基團,作者在中性pH的水溶液中照射并分析它們的減少以及天然鳥苷的形成的HPLC和LC-MS譜圖。結(jié)果表明,在365?nm處,短時間照射(5-15?s)足以去除10?μL 500?μM 溶液中的光裂解基團,釋放游離鳥苷。在 405?nm,NP、NPM和DMNB組在60?s后被有效去除,比ONB組更有效。在420?nm,NPM組在120?s后完全去除。因此,作者最終選擇了DMNB和NPM組進行進一步研究,并合成了各自的cap0類似物。生成的FlashCaps在N2位置包含DMNB或NPM基團。它們在300 nm以上的吸收光譜和它們的解籠罩動力學(xué)類似于各自的光籠鳥苷。其還還通過在細(xì)胞裂解物中孵育cap 0或FlashCaps,然后進行HPLC分析來評估氨基甲酸酯鍵的生物穩(wěn)定性。FlashCaps在30小時內(nèi)表現(xiàn)出高穩(wěn)定性,表明氨基甲酸酯鍵不是裂解液降解的主要點。

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圖4.  光可裂解基團 (FlashCaps)基本表征(圖片來源:Nat. Chem.

隨后,作者評估了光可裂解基團如何影響5'帽與eIF4E的相互作用。在光籠帽存在的情況下,使用微量熱泳(MST)對FlashCaps和Cy5標(biāo)記的eIF4E的結(jié)合測量發(fā)現(xiàn)沒有產(chǎn)生結(jié)合曲線。在相同條件下,光誘導(dǎo)去除光籠基后,則獲得了與帽0相似范圍內(nèi)的特征結(jié)合曲線和Kd值(0.3?μM),表明帽0有效形成。作者同時還研究了光可裂解基團如何影響與帽修飾酶的相互作用。DcpS是一種焦磷酸酶,可在真核細(xì)胞中將帽結(jié)構(gòu)水解為m7GMP和GDP。結(jié)果表明,與eIF4E的結(jié)果相似,DcpS——一種結(jié)合但非切割的脫帽酶變體——與cap0相互作用,但不與FlashCaps相互作用。

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圖5. 光可裂解基團 (FlashCaps)修飾的mRNA基本表征(圖片來源:Nat. Chem.

總結(jié)

隨著新冠的大爆發(fā),信使RNA(mRNA)新冠疫苗再次成為研究熱點,其中以Moderna和BioNTech/Pfizer為代表,它們編碼刺突蛋白可有效防止SARS-CoV-2感染。mRNA技術(shù)不僅限于疫苗接種,還可改善自身免疫性疾病以及實現(xiàn)個性化的癌癥治療。然而,到目前為止,還沒有策略可以有效實現(xiàn)定時、定點mRNA表達(dá),即在不改變mRNA性能的前提下控制特定組織的遞送和攝取。在本文中,研究人員開發(fā)了一種通過光控制mRNA翻譯的技術(shù)——FlashCaps。FlashCaps作為mRNA5'帽類似物,通過裂解氨基甲酸酯鍵連接的單個光籠基基團,導(dǎo)致快速有效地釋放天然結(jié)構(gòu)。FlashCap-mRNAs具有以下優(yōu)勢:(1)僅包含一個光可切割基團;(2)無光照時可暫停蛋白質(zhì)翻譯;(3)定時、定點釋放天然 cap 0(無帽結(jié)構(gòu))-mRNA;(4)不改變mRNA自身序列;(5)不具有免疫原性。

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圖6.  Andrea Rentmeister 教授(圖片來源:Muenster university)

Andrea Rentmeister教授在格拉茨大學(xué)和波恩大學(xué)獲得化學(xué)工程和化學(xué)專業(yè)博士學(xué)位,之后加入加州理工學(xué)院弗朗西斯·阿諾德實驗室(2018年諾貝爾獎獲得者)進行博士后研究。2010年成為漢堡大學(xué)生物化學(xué)初級教授。目前,她在明斯特大學(xué)擔(dān)任生物分子標(biāo)記化學(xué)教授。致力于了解mRNA翻譯機制并最終控制其特定轉(zhuǎn)錄及翻譯。開發(fā)多種化學(xué)和化學(xué)酶促方法,對mRNA進行分子水平上操作、分析以及控制,并將其應(yīng)用于活細(xì)胞以及體內(nèi)。

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圖7. Andrea代表奧地利參加2000年夏季奧運會參賽照片圖片來源:Imago)

文章詳情:

Kl?cker, N., Weissenboeck, F.P., van Dülmen, M. et al. Photocaged 5′ cap analogues for optical control of mRNA translation in cells. Nat. Chem. (2022). https://doi.org/10.1038/s41557-022-00972-7


課題組網(wǎng)頁:https://www.uni-muenster.de/Cells-in-Motion/people/all/rentmeister-a.php

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