G蛋白偶聯(lián)受體(G protein-coupled receptor, GPCR)在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮重要作用,介導(dǎo)并調(diào)控人體的各類生命活動(dòng)。這類受體與眾多疾病密切相關(guān),是最大的藥物靶標(biāo)蛋白家族,超過(guò)40%的上市藥物通過(guò)與這些受體作用發(fā)揮其療效,但目前還有大量靶向該家族的藥物處于研發(fā)階段,圍繞GPCR的藥物研發(fā)一直是國(guó)際醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的競(jìng)爭(zhēng)高地。
雖然近年來(lái)對(duì)GPCR的結(jié)構(gòu)與藥理學(xué)研究不斷有突破性成果產(chǎn)生,但至今仍有100余種GPCR的配體和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路不明,這些孤兒受體相關(guān)的研究極為匱乏,極大地制約了對(duì)于GPCR生理功能與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制的全面認(rèn)識(shí)。值得一提的是,孤兒受體作為藥物開(kāi)發(fā)的“處女地”,是潛在的藥物靶標(biāo)“源泉”,為創(chuàng)新藥物研發(fā)帶來(lái)機(jī)遇。
近日,中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所吳蓓麗研究組、趙強(qiáng)研究組聯(lián)合上??萍即髮W(xué)水雯箐研究組,在孤兒受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制研究方面取得突破性進(jìn)展。該研究團(tuán)隊(duì)成功解析兩種黏附類GPCR(adhesion GPCR)ADGRD1和ADGRF1分別與G蛋白結(jié)合的復(fù)合物三維結(jié)構(gòu),并開(kāi)展了深入的功能相關(guān)性研究,首次闡明這類孤兒受體自發(fā)激活的分子機(jī)制,為研究該類受體的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)理和未來(lái)的藥物設(shè)計(jì)提供了重要依據(jù)。相關(guān)研究論文于北京時(shí)間2022年4月13日在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊Nature上在線發(fā)表。
黏附類GPCR包含33種受體,參與調(diào)控免疫反應(yīng)、器官發(fā)育和細(xì)胞通訊等生理過(guò)程,與精神分裂癥、多動(dòng)癥和癌癥等多種疾病密切相關(guān)。然而,該類受體是目前研究最不透徹的GPCR家族,幾乎所有成員都是配體未知和功能不明的孤兒受體,其結(jié)構(gòu)和功能研究的匱乏嚴(yán)重制約了相關(guān)的藥物研發(fā)進(jìn)程。ADGRD1和ADGRF1作為兩種黏附類受體,被發(fā)現(xiàn)是多種癌癥的致癌基因,但其在分子水平上如何被激活和調(diào)控,相關(guān)的作用機(jī)制仍不清楚。 此次,上海藥物所的聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)測(cè)定ADGRD1和ADGRF1分別與G蛋白結(jié)合的復(fù)合物結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)受體自身的一部分可作為內(nèi)源性激動(dòng)劑,使受體激活。這個(gè)充當(dāng)激動(dòng)劑的部分是位于受體胞外結(jié)構(gòu)域和跨膜結(jié)構(gòu)域之間的一段多肽(包含約20個(gè)氨基酸),被稱為“stalk”。該區(qū)段通過(guò)與受體跨膜結(jié)構(gòu)域作用,導(dǎo)致跨膜螺旋發(fā)生構(gòu)象變化,從而激活受體,使其與G蛋白結(jié)合。這種受體自發(fā)激活方式從未在其它類型GPCR中被發(fā)現(xiàn),充分體現(xiàn)了黏附類受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制的獨(dú)特性。 ADGRD1和ADGRF1分別與G蛋白結(jié)合的復(fù)合物三維結(jié)構(gòu)動(dòng)圖 不同于其它GPCR,黏附類受體的N端含有一個(gè)巨大的胞外結(jié)構(gòu)域,不同類型黏附類受體的胞外結(jié)構(gòu)域組成差異巨大。盡管如此,幾乎所有黏附類受體的胞外結(jié)構(gòu)域中都包含一個(gè)自剪切結(jié)構(gòu)域(GPCR autoproteolysis-inducing, GAIN),該結(jié)構(gòu)域中含有一個(gè)自剪切位點(diǎn),使受體斷裂成N端和C端兩個(gè)部分,自剪切位點(diǎn)和跨膜結(jié)構(gòu)域之間的區(qū)段即為stalk。以往研究發(fā)現(xiàn),雖然受體發(fā)生斷裂,stalk仍然與GAIN結(jié)構(gòu)域的其它部分緊密結(jié)合。而ADGRD1和ADGRF1與G蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu)顯示,stalk從GAIN結(jié)構(gòu)域中脫離,發(fā)生顯著的構(gòu)象變化,促使其伸入到受體跨膜結(jié)構(gòu)域的結(jié)合口袋中,這說(shuō)明stalk的構(gòu)象重排對(duì)于受體激活至關(guān)重要。 以往人們普遍認(rèn)為黏附類受體發(fā)生自剪切有利于GAIN結(jié)構(gòu)域釋放stalk,從而促進(jìn)受體自激活。然而,此次研究人員將ADGRD1和ADGRF1的自剪切位點(diǎn)突變,使其喪失自剪切能力,受體激活下游信號(hào)通路的能力卻沒(méi)有發(fā)生顯著變化。更加出乎意料的是,研究人員進(jìn)一步解析了ADGRF1自剪切突變體與G蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)stalk仍能通過(guò)同樣的方式與跨膜結(jié)構(gòu)域作用激活受體。這些研究結(jié)果表明,自剪切對(duì)于stalk釋放和受體自激活不是必需的。 黏附類受體結(jié)構(gòu)示意圖。黏附類受體在細(xì)胞黏附和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮重要作用,是癌癥和神經(jīng)系統(tǒng)疾病等的潛在藥物作用靶點(diǎn)。圖中處于不同功能狀態(tài)的ADGRF1結(jié)構(gòu)或模型用橙色飄帶圖表示,受體中的stalk區(qū)域用紅色表示,脂分子LPC用綠色表示,GAIN結(jié)構(gòu)域?yàn)榇u紅色,G蛋白的三個(gè)亞基分別為黃色,淺粉色和淺灰色。(圖片由吳蓓麗研究組提供) ADGRD1和ADGRF1的氨基酸序列相似性很低,但這兩種受體的結(jié)構(gòu)顯示stalk與跨膜結(jié)構(gòu)域之間形成的相互作用力非常相似,提示不同類型黏附類受體可能通過(guò)類似的方式自發(fā)激活下游信號(hào)通路。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),不同跨膜螺旋中的氨基酸憑借彼此間的相互作用形成一系列作用力核心,這些作用力核心像傳遞“接力棒”一樣,將stalk在受體細(xì)胞外側(cè)區(qū)域引發(fā)的構(gòu)象變化向細(xì)胞內(nèi)側(cè)方向傳送,最終完全激活受體。對(duì)受體的功能研究顯示,將構(gòu)成這些作用力核心的氨基酸突變后,受體自激活的能力顯著下降,表明這些作用力對(duì)于受體激活至關(guān)重要。 這些結(jié)構(gòu)和功能信息為藥物設(shè)計(jì)提供了精準(zhǔn)的模板,將有助于靶向這兩種黏附類受體的癌癥治療藥物開(kāi)發(fā)。 該研究的另外一項(xiàng)重要發(fā)現(xiàn)是一種天然脂分子通過(guò)與ADGRF1特異性結(jié)合對(duì)受體功能進(jìn)行調(diào)控。聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)在ADGRF1與G蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu)中發(fā)現(xiàn)一個(gè)脂分子與受體中G蛋白結(jié)合口袋附近的一個(gè)位點(diǎn)結(jié)合,而在另一個(gè)受體ADGRD1的結(jié)構(gòu)中則沒(méi)有發(fā)現(xiàn)脂分子。研究人員進(jìn)一步利用質(zhì)譜與組學(xué)技術(shù)鑒定該脂分子的結(jié)構(gòu)為溶血磷脂膽堿(lysophosphatidylcholine,LPC)。進(jìn)一步的功能研究表明,LPC可能通過(guò)穩(wěn)定受體胞內(nèi)側(cè)區(qū)域的構(gòu)象促進(jìn)受體激活。這是首次發(fā)現(xiàn)細(xì)胞膜的脂質(zhì)成分LPC與GPCR結(jié)合并對(duì)受體功能發(fā)揮調(diào)控作用,極大地拓展了對(duì)于GPCR功能調(diào)控機(jī)制的認(rèn)識(shí)。 圖為本研究部分第一作者。左起邱娜、瞿向利、王沐。 中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所吳蓓麗研究員、趙強(qiáng)研究員和上??萍即髮W(xué)水雯箐教授是研究論文的共同通訊作者,第一作者是上海藥物所博士生瞿向利、碩士生邱娜和上??萍即髮W(xué)博士生王沐、助理研究員張冰潔。研究工作獲得國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)、國(guó)家科技部、中國(guó)科學(xué)院和上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)等部門(mén)的經(jīng)費(fèi)支持。 全文鏈接 https://www.nature.com/articles/s41586-022-04580-w ★ 專家點(diǎn)評(píng) ★ 劉志杰 (上??萍即髮W(xué)iHuman研究所執(zhí)行所長(zhǎng)、教授) 黏附類GPCR(adhesion GPCR,aGPCR)是一類在正常生理狀態(tài)和疾病發(fā)生發(fā)展中都具有重要功能的受體,與多種人體疾病有關(guān),包括神經(jīng)管缺陷、脊柱裂、腦畸形和癌癥等等。其復(fù)雜的生理功能和巨大的藥物研發(fā)潛力使人們?cè)絹?lái)越關(guān)注這類受體,但是這些受體的研究極具挑戰(zhàn)性,這是因?yàn)閍GPCR具有非常復(fù)雜的分子結(jié)構(gòu)和獨(dú)特的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制,這些極大地制約了這類受體的功能研究和藥物研發(fā)。目前,人們對(duì)于aGPCR在功能調(diào)控機(jī)制、相互作用網(wǎng)絡(luò)和藥理基礎(chǔ)等方面的認(rèn)識(shí)遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后于其它 GPCR 家族,大部分aGPCR仍然是孤兒受體。 此次,上海藥物所和上??萍即髮W(xué)的聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)測(cè)定ADGRD1和ADGRF1與G蛋白的復(fù)合物結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)兩種aGPCR分子中跨膜結(jié)構(gòu)域前的一段多肽stalk可作為內(nèi)源性激動(dòng)劑激活受體,首次在原子水平上揭示了該類受體的自發(fā)激活機(jī)制。Stalk區(qū)段通過(guò)與受體跨膜結(jié)構(gòu)域作用,導(dǎo)致跨膜螺旋發(fā)生構(gòu)象變化,再通過(guò)一系列獨(dú)特的跨膜螺旋間的作用力核心將構(gòu)象變化傳遞至細(xì)胞內(nèi)側(cè),從而激活受體。這是一種從未在其它類型GPCR中發(fā)現(xiàn)的自激活模式,其分子機(jī)理的揭示為這類受體的功能研究和藥物研發(fā)提供了重要基礎(chǔ)。此外,該研究還發(fā)現(xiàn)并鑒定了細(xì)胞膜的天然脂質(zhì)成分溶血磷脂膽堿(lysophosphatidylcholine,LPC)通過(guò)與ADGRF1特異性結(jié)合對(duì)受體功能進(jìn)行調(diào)控,為靶向該受體的藥物設(shè)計(jì)指明了新方向。這項(xiàng)研究極大地拓展了我們對(duì)aGPCR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和功能調(diào)控機(jī)制的認(rèn)知,對(duì)于后續(xù)的功能研究和藥物研發(fā)將產(chǎn)生重要影響。 徐彥輝 (復(fù)旦大學(xué)教授) 黏附類GPCR參與調(diào)控機(jī)體的多種生理活動(dòng),與癌癥和精神分裂癥等疾病密切相關(guān)。該類受體具有巨大的胞外結(jié)構(gòu)域,在細(xì)胞黏附與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程中發(fā)揮著雙重作用。由于黏附類受體的分子結(jié)構(gòu)和功能調(diào)控機(jī)制非常復(fù)雜,且大部分成員為配體未知的孤兒受體,相關(guān)的結(jié)構(gòu)與功能研究具有極大挑戰(zhàn)性。以往研究表明,與其它類型GPCR不同,大多數(shù)黏附類受體會(huì)發(fā)生自剪切,斷裂成N端和C端兩個(gè)片段,位于C端片段頭部的一段多肽stalk可充當(dāng)激動(dòng)劑,使受體激活并引發(fā)下游信號(hào),但相關(guān)的分子機(jī)制一直不清楚,極大地限制了對(duì)于這類受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制的深入理解。 在此次研究中,上海藥物所的研究團(tuán)隊(duì)克服了一系列困難,成功解析了兩種黏附類受體ADGRD1和ADGRF1分別與多種G蛋白的復(fù)合物電鏡結(jié)構(gòu),并利用多種細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)實(shí)驗(yàn)開(kāi)展受體功能研究。首次闡明stalk通過(guò)與跨膜結(jié)構(gòu)域作用自發(fā)激活受體的分子機(jī)制,并對(duì)受體自剪切在自激活過(guò)程中發(fā)揮的作用進(jìn)行探索,在此基礎(chǔ)上提出了自剪切型與非自剪切型黏附類GPCR的自激活模型。該研究還發(fā)現(xiàn)黏附類受體的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)模式具有多樣性,不同類型受體通過(guò)不同的構(gòu)象變化和不同的分子內(nèi)作用力傳遞信號(hào)。此外,結(jié)構(gòu)和功能研究證實(shí)ADGRF1受體的激活還受到天然脂分子溶血磷脂膽堿(LPC)的特異性調(diào)控。這些研究結(jié)果充分體現(xiàn)黏附類GPCR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和調(diào)控機(jī)制的獨(dú)特性、復(fù)雜性和多樣性,有效地促進(jìn)了對(duì)于這類孤兒受體發(fā)揮功能的分子機(jī)制的理解,為研究大量結(jié)構(gòu)、功能未知的孤兒受體提供了新思路,并為挖掘其藥物研發(fā)潛力提供新的線索。上述突破性成果源于吳蓓麗和趙強(qiáng)聯(lián)合團(tuán)隊(duì)在GPCR研究領(lǐng)域十余年來(lái)的深厚積累和對(duì)領(lǐng)域核心問(wèn)題持之以恒的探索。
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